انجمن شرکت های هواپیمایی فعالیت خود را به طورغیر رسمی در سال 1376 آغاز کرد و یک سال بعد، پس از اخذ مجوز تشکیل از وزارت کار و امور اجتماعی به یک تشکل رسمی تبدیل شد. در ابتدای تاسیس انجمن، شرکت های هواپیمایی مسافری بخش غیردولتی و خصوصی و سپس شرکت های هواپیمایی بار و شرکت های هلی کوپتری نیز به عضویت آن درآمدند. انجمن تا قبل از سال 1382 تنهاسخنگوی بخش خصوصی صنعت هواپیمایی بود ولی از این سال به بعد شرکت های هواپیمایی دولتی نیز به آن پیوستند.